MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli B str. REL606 chromosome

Total Repeats: 82074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012967	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160124
2	NC_012967	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160124
3	NC_012967	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160125
4	NC_012967	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	254160125
5	NC_012967	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	254160125
6	NC_012967	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	254160125
7	NC_012967	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160125
8	NC_012967	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
9	NC_012967	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	254160125
10	NC_012967	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160125
11	NC_012967	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160125
12	NC_012967	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160125
13	NC_012967	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	254160125
14	NC_012967	GC	3	6	753	758	0 %	0 %	50 %	50 %	254160125
15	NC_012967	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160125
16	NC_012967	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160125
17	NC_012967	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160125
18	NC_012967	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160125
19	NC_012967	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160125
20	NC_012967	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160125
21	NC_012967	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	254160125
22	NC_012967	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160125
23	NC_012967	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	254160125
24	NC_012967	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160125
25	NC_012967	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254160125
26	NC_012967	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
27	NC_012967	AAT	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254160125
28	NC_012967	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160125
29	NC_012967	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	254160125
30	NC_012967	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160125
31	NC_012967	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160125
32	NC_012967	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	254160125
33	NC_012967	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160125
34	NC_012967	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160125
35	NC_012967	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254160125
36	NC_012967	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
37	NC_012967	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160125
38	NC_012967	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160125
39	NC_012967	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254160125
40	NC_012967	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	254160125
41	NC_012967	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160125
42	NC_012967	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160125
43	NC_012967	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160125
44	NC_012967	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	254160125
45	NC_012967	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254160125
46	NC_012967	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160125
47	NC_012967	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160125
48	NC_012967	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160125
49	NC_012967	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
50	NC_012967	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
51	NC_012967	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160125
52	NC_012967	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
53	NC_012967	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254160125
54	NC_012967	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160125
55	NC_012967	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160125
56	NC_012967	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	254160125
57	NC_012967	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
58	NC_012967	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160125
59	NC_012967	TGCC	2	8	2594	2601	0 %	25 %	25 %	50 %	254160125
60	NC_012967	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254160125
61	NC_012967	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160125
62	NC_012967	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160126
63	NC_012967	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160126
64	NC_012967	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254160126
65	NC_012967	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	254160126
66	NC_012967	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160126
67	NC_012967	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	254160126
68	NC_012967	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160126
69	NC_012967	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160126
70	NC_012967	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160126
71	NC_012967	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160126
72	NC_012967	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160126
73	NC_012967	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	254160126
74	NC_012967	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160126
75	NC_012967	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160126
76	NC_012967	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	254160126
77	NC_012967	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	254160126
78	NC_012967	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	254160126
79	NC_012967	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160126
80	NC_012967	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	254160126
81	NC_012967	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254160126
82	NC_012967	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	254160126
83	NC_012967	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160126
84	NC_012967	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	254160127
85	NC_012967	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	254160127
86	NC_012967	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160127
87	NC_012967	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160127
88	NC_012967	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	254160127
89	NC_012967	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160127
90	NC_012967	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160127
91	NC_012967	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160127
92	NC_012967	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160127
93	NC_012967	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	254160127
94	NC_012967	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160127
95	NC_012967	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160127
96	NC_012967	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160127
97	NC_012967	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160127
98	NC_012967	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254160127
99	NC_012967	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160127
100	NC_012967	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160127
101	NC_012967	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160127
102	NC_012967	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	254160127
103	NC_012967	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160127
104	NC_012967	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160127
105	NC_012967	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160127
106	NC_012967	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160127
107	NC_012967	GCA	2	6	5289	5294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160128
108	NC_012967	TGG	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160128
109	NC_012967	ACA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254160128
110	NC_012967	CCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160128
111	NC_012967	CCG	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160128
112	NC_012967	CCA	2	6	5465	5470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160128
113	NC_012967	CTC	2	6	5479	5484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254160128
114	NC_012967	ATC	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160128
115	NC_012967	CGG	2	6	5495	5500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160128
116	NC_012967	GCT	2	6	5686	5691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160129
117	NC_012967	GGA	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254160129
118	NC_012967	TCA	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160129
119	NC_012967	AAG	2	6	5739	5744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160129
120	NC_012967	CAGT	2	8	5764	5771	25 %	25 %	25 %	25 %	254160129
121	NC_012967	AAT	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254160129
122	NC_012967	TCA	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160129
123	NC_012967	TTC	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254160129
124	NC_012967	TTC	2	6	5910	5915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254160129
125	NC_012967	CAC	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160129
126	NC_012967	TGC	2	6	5975	5980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160129
127	NC_012967	TTG	2	6	5997	6002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160129
128	NC_012967	TGA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160129
129	NC_012967	AAATCG	2	12	6150	6161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254160129
130	NC_012967	AGCG	2	8	6268	6275	25 %	0 %	50 %	25 %	254160129
131	NC_012967	CTG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160129
132	NC_012967	GTG	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254160129
133	NC_012967	CAT	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160130
134	NC_012967	GGC	2	6	6568	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160130
135	NC_012967	GCC	2	6	6758	6763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160130
136	NC_012967	GTT	2	6	6812	6817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160130
137	NC_012967	AGA	2	6	6829	6834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160130
138	NC_012967	ATC	2	6	7056	7061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160130
139	NC_012967	CGC	2	6	7100	7105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160130
140	NC_012967	TGCCGC	2	12	7106	7117	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254160130
141	NC_012967	CGC	2	6	7202	7207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160130
142	NC_012967	GCC	2	6	7208	7213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160130
143	NC_012967	GCCA	2	8	7225	7232	25 %	0 %	25 %	50 %	254160130
144	NC_012967	CAG	2	6	7385	7390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160130
145	NC_012967	AAT	2	6	7406	7411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254160130
146	NC_012967	CG	3	6	7552	7557	0 %	0 %	50 %	50 %	254160130
147	NC_012967	AGA	2	6	7678	7683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160130
148	NC_012967	CGG	2	6	7699	7704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160130
149	NC_012967	CG	3	6	7744	7749	0 %	0 %	50 %	50 %	254160130
150	NC_012967	CAA	2	6	7878	7883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254160130
151	NC_012967	TAA	2	6	7933	7938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254160130
152	NC_012967	A	6	6	7944	7949	100 %	0 %	0 %	0 %	254160130
153	NC_012967	GCAT	2	8	7954	7961	25 %	25 %	25 %	25 %	254160130
154	NC_012967	ACC	2	6	8269	8274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160131
155	NC_012967	CAAC	2	8	8333	8340	50 %	0 %	0 %	50 %	254160131
156	NC_012967	TC	3	6	8344	8349	0 %	50 %	0 %	50 %	254160131
157	NC_012967	CGCAG	2	10	8358	8367	20 %	0 %	40 %	40 %	254160131
158	NC_012967	TTGA	2	8	8386	8393	25 %	50 %	25 %	0 %	254160131
159	NC_012967	CAG	2	6	8416	8421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160131
160	NC_012967	CG	3	6	8431	8436	0 %	0 %	50 %	50 %	254160131
161	NC_012967	CAG	2	6	8437	8442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160131
162	NC_012967	CGAC	2	8	8453	8460	25 %	0 %	25 %	50 %	254160131
163	NC_012967	TGC	2	6	8658	8663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160131
164	NC_012967	AAG	2	6	8678	8683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160131
165	NC_012967	CTG	2	6	8704	8709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160131
166	NC_012967	TTG	2	6	8768	8773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254160131
167	NC_012967	AAGA	2	8	8809	8816	75 %	0 %	25 %	0 %	254160131
168	NC_012967	AGA	2	6	8829	8834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160131
169	NC_012967	TAC	2	6	8869	8874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160131
170	NC_012967	CTG	2	6	8977	8982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160131
171	NC_012967	GCTG	2	8	8988	8995	0 %	25 %	50 %	25 %	254160131
172	NC_012967	GCA	2	6	9084	9089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160131
173	NC_012967	A	6	6	9164	9169	100 %	0 %	0 %	0 %	254160131
174	NC_012967	CTG	2	6	9181	9186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160131
175	NC_012967	TGA	2	6	9302	9307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160132
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177	NC_012967	GAA	2	6	9388	9393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160132
178	NC_012967	ATC	2	6	9460	9465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160132
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182	NC_012967	CGTAC	2	10	9786	9795	20 %	20 %	20 %	40 %	254160132
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189	NC_012967	CAG	2	6	10079	10084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160133
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195	NC_012967	CAG	2	6	10325	10330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160133
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199	NC_012967	GTC	2	6	11383	11388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160134
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248	NC_012967	ACTG	2	8	13864	13871	25 %	25 %	25 %	25 %	254160135
249	NC_012967	CAG	2	6	13967	13972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160135
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254	NC_012967	A	6	6	14069	14074	100 %	0 %	0 %	0 %	254160135
255	NC_012967	ATT	2	6	14179	14184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254160136
256	NC_012967	ACC	2	6	14260	14265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160136
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261	NC_012967	GGC	2	6	14472	14477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160136
262	NC_012967	GTC	2	6	14485	14490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160136
263	NC_012967	GCG	2	6	14496	14501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254160136
264	NC_012967	CG	3	6	14500	14505	0 %	0 %	50 %	50 %	254160136
265	NC_012967	GAA	2	6	14541	14546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160136
266	NC_012967	GCA	2	6	14702	14707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160136
267	NC_012967	CAA	2	6	14756	14761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254160136
268	NC_012967	GTCATG	2	12	14764	14775	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254160136
269	NC_012967	GCA	2	6	14788	14793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160136
270	NC_012967	GTTCAG	2	12	14901	14912	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254160136
271	NC_012967	CAA	2	6	14945	14950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254160136
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275	NC_012967	CTT	2	6	15251	15256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254160136
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280	NC_012967	CGC	3	9	15539	15547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160137
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282	NC_012967	GGCT	2	8	15582	15589	0 %	25 %	50 %	25 %	254160137
283	NC_012967	G	6	6	15599	15604	0 %	0 %	100 %	0 %	254160137
284	NC_012967	GCC	2	6	15692	15697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160137
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287	NC_012967	CAG	2	6	15889	15894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160137
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291	NC_012967	TCC	2	6	16195	16200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254160137
292	NC_012967	TCG	2	6	16243	16248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254160137
293	NC_012967	AGT	2	6	16258	16263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160137
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299	NC_012967	GAC	2	6	16490	16495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160137
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301	NC_012967	AGA	2	6	16545	16550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254160137
302	NC_012967	GCC	2	6	16837	16842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254160139
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342	NC_012967	TGA	2	6	19399	19404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254160141
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345	NC_012967	ATT	2	6	19585	19590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254160141
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370	NC_012967	AT	4	8	20638	20645	50 %	50 %	0 %	0 %	254160143
371	NC_012967	GTTTT	2	10	20646	20655	0 %	80 %	20 %	0 %	254160143
372	NC_012967	TCA	2	6	20700	20705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254160143
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374	NC_012967	AAT	2	6	20918	20923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254160143
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378	NC_012967	GC	3	6	21064	21069	0 %	0 %	50 %	50 %	254160143
379	NC_012967	ACC	2	6	21131	21136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254160143
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382	NC_012967	TAT	2	6	21212	21217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254160143
383	NC_012967	ATT	2	6	21263	21268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254160143
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389	NC_012967	CTC	2	6	21461	21466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254160143
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499	NC_012967	CGA	2	6	28016	28021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254160152
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